A SANEAGRO tem na elaboração e implantação de qualquer projeto de engenharia rural um desafio de conciliar pesquisa e exploração do recursos naturais com a preservação ambiental, sem comprometer ecossistemas, conservação de mananciais e mata ciliares.
As questões ambientais a nível mundial, deixaram de ser tratadas como demandas de um grupo de radicais ecológicos e passaram a integrar-se aos assuntos socioeconômicos dos países preocupados com a proteção da natureza e o seu manejo.